Từ ngày 9/5, Vietnam Airlines Group (bao gồm các hãng Vietnam Airlines, Pacific Airlines và Vasco) sẽ thực hiện điều chỉnh phí quản trị hệ thống từ 350.000 đồng lên 450.000 đồng, tăng 100.000 đồng/chiều/hành khách. Điều chỉnh này áp dụng trên tất các các chuyến bay nội địa.
Bamboo Airways cũng cho biết sẽ tăng phí quản trị hệ thống theo mức tăng so với vé lẻ và vé đoàn, bắt đầu áp dụng đối với xác nhận đặt chỗ từ ngày 10/5. Theo đó, vé đoàn sẽ áp dụng phí quản trị hệ thống tăng từ 370.000 đồng lên 460.000 đồng (tăng 90.000 đồng/chiều/hành khách). Đối với khách lẻ, mức điều chỉnh là từ 320.000 lên 410.000 đồng (tăng 90.000 đồng/chiều/hành khách).
Bamboo Airways cho biết, một số giá đoàn kích cầu, đoàn đặc biệt có thể không áp dụng phụ thu quản trị hệ thống. Hãng cũng không áp dụng tăng thu phí quản trị hệ thống đối với gói sản phẩm trả trước trọn gói combo, giá trao đổi có hiệu lực trước 10/5 và có mức giá công bố căn cứ trên mức giá tổng.
Trong tổng giá vé mà hành khách phải chi trả mỗi khi di chuyển bằng máy bay, các hãng hàng không sẽ thu khoản tổng cộng gồm giá vé gốc, thuế và các loại phí. Các loại phí như phí soi chiếu an ninh hành khách và hành lý, phí dịch vụ hành khách sẽ được các hãng bay thu hộ, hoàn trả cho đơn vị cung cấp dịch vụ, thường là Tổng công ty Cảng hàng không Việt Nam (ACV), đơn vị khai thác 22 trên 23 sân bay dân dụng tại Việt Nam.
Tuy nhiên, các hãng bay sẽ giữ lại khoản phí quản trị hệ thống. Đây là khoản phí lớn nhất trong các hạng mục phí cấu thành giá vé. Theo các hãng bay, đây là khoản thu nhằm mục đích nâng cao chất lượng quản trị dữ liệu hành khách cũng như đáp ứng yêu cầu phát triển hệ thống này trong tương lai.
Lần gần nhất Vietnam Airlines Group điều chỉnh tăng phí quản trị hệ thống là vào tháng 4/2020, mức tăng từ 250.000 đồng/chiều/hành khách lên 350.000 đồng/chiều/hành khách. Cũng vào tháng 4/2020, Bamboo Airways đã điều chỉnh phí quản trị hệ thống thêm 70.000 đồng/chiều/hành khách, từ 250.000 đồng lên 320.000 đồng.
Vietjet Air đang thu phí quản trị hệ thống ở mức 310.000 đồng/chiều/hành khách. Đây là mức thu được áp dụng từ tháng 7/2020 khi trước đó hãng áp dụng mức phí quản trị hệ thống 280.000 đồng/chiều/hành khách.
Tân binh Vietravel Airlines cũng đang thu phí quản trị hệ thống theo mặt bằng chung của thị trường. Hiện hãng áp dụng mức phí quản trị hệ thống 310.000 đồng đồng/chiều/hành khách, cùng Vietjet Air ở mức thấp nhất trong các hãng bay Việt.
Giai đoạn 2017-2018, phí quản trị hệ thống của các hãng hàng không Việt phổ biến ở mức 110.000 - 150.000 đồng/chiều/hành khách. Tuy nhiên trong 2 năm trở lại đây mức phí này đã tăng mạnh, đặc biệt là giai đoạn tháng 4/2020 khi dịch Covid-19 bùng phát tại Việt Nam và thế giới.