Đến 12h ngày 2/2, thi thể một người đàn ông (khoảng 65 tuổi), bị tàu hoả tông chết vẫn đang lưu tại bệnh viện 175 để cơ quan CSĐT Công an quận Thủ Đức, TP HCM để điều tra làm rõ nguyên nhân tử vong, trước khi bàn giao cho gia đình lo hậu sự.
Trước đó, khoảng 9h30 cùng ngày, người đàn ông nói trên từ nhà gần khu vực cầu đường sắt Bình Lợi (đoạn cách trụ sở Công an phường Hiệp Bình Chánh, quận Thủ Đức khoảng 300m) đi bộ băng ngang đường tàu lửa Bắc - Nam.
Đúng lúc này, đoàn tàu khách mang ký hiệu TN5 từ phía Bắc vào ga Sài Gòn ầm ầm lao đến và kéo còi inh ỏi. Tuy nhiên người đàn ông vẫn cố băng ngang và bị đoàn tàu lao qua hất văng nhiều mét. Do thương tích quá nặng nên nạn nhân đã tử vong trước khi đến bệnh viện.
Sau tai nạn, đoàn tàu tạm dừng lại khoảng 15 phút để trưởng tàu lập biên bản, bàn giao vụ việc cho Công an địa phương rồi tiếp tục hành trình.