Theo Quyết định số 5507-QĐ/TU, Bí thư Thành ủy Đinh Tiến Dũng là Trưởng ban.
Phó Trưởng ban Thường trực là ông Trần Sỹ Thanh, Chủ tịch UBND TP. Hà Nội. 3 Phó Trưởng ban gồm: bà Nguyễn Thị Tuyến, Phó Bí thư Thường trực Thành ủy; ông Nguyễn Ngọc Tuấn, Chủ tịch HĐND TP. Hà Nội; ông Nguyễn Văn Phong, Phó Bí thư Thành ủy Hà Nội.
Các thành viên Ban Chỉ đạo TP là các Ủy viên Ban Thường vụ Thành ủy, Trưởng các ban Đảng Thành ủy, lãnh đạo Thường trực HĐND, UBND TP, Chủ tịch Ủy ban MTTQ Việt Nam TP. Hà Nội...
Ban Chỉ đạo TP lãnh đạo, chỉ đạo, thực hiện việc sắp xếp các đơn vị hành chính trên địa bàn Thủ đô theo Kết luận của Bộ Chính trị, Nghị quyết của Ủy ban Thường vụ Quốc hội và Nghị quyết của Chính phủ. Nhiệm vụ cụ thể của các thành viên Ban Chỉ đạo do Trưởng ban chỉ đạo phân công.
Ngoài ra, Ban Thường vụ Thành ủy Hà Nội cũng đã ban hành Quyết định số 5508-QĐ/TU thành lập Tổ giúp việc Ban Chỉ đạo thực hiện sắp xếp đơn vị hành chính trên địa bàn TP. Hà Nội, giai đoạn 2023-2025.
Ông Vũ Đức Bảo, Trưởng ban Tổ chức Thành ủy là Tổ trưởng. Hai tổ phó là Phó Chủ tịch UBND TP. Hà Nội Hà Minh Hải và Giám đốc Sở Nội vụ Trần Đình Cảnh. Tổ giúp việc có 10 thành viên là giám đốc một số sở và cán bộ Ban Tổ chức Thành ủy.
Tổ giúp việc có nhiệm vụ nghiên cứu, tham mưu cho Ban Chỉ đạo thực hiện sắp xếp đơn vị hành chính trên địa bàn TP. Hà Nội các chủ trương, trình tự, thủ tục, hồ sơ đề án sắp xếp đơn vị hành chính trên địa bàn TP. Hà Nội theo Kết luận của Bộ Chính trị, Nghị quyết của Ủy ban Thường vụ Quốc hội và Nghị định của Chính phủ.
Tổ giúp việc đồng thời nghiên cứu, tham mưu cho Ban Chỉ đạo TP việc kiện toàn tổ chức bộ máy và áp dụng các chế độ, chính sách đặc thù của đơn vị hành chính hình thành sau sắp xếp; đồng thời thực hiện các nhiệm vụ khác theo yêu cầu của Ban Chỉ đạo.