Theo đó, nguyên nhân sơ bộ ban đầu được ông Trần Văn Thành, Giám đốc Sở Y tế tỉnh Quảng Trị cho biết là: "sốc phản vệ chưa rõ nguyên nhân".
Kết luận về dịch vụ tiêm chủng tại Bệnh viện Đa khoa huyện Hướng Hóa, hội đồng chuyên môn chỉ rõ: thứ nhất việc bảo quản vắc xin chưa đúng quy định, để vắc xin cùng sinh phẩm khác.
Thứ 2 quản lý vắc xin mắc nhiều “lỗi”: không ghi chép quản lý vắc xin hàng ngày, không lưu vỏ, lọ theo quy định và không triển khai tiêm vắc xin tại phòng tiêm riêng mà tiêm tại phòng bệnh.
Theo hội đồng chuyên môn, đây là chùm ca bệnh. Cả 3 ca tử vong về lâm sàng đều diễn biến rất nhanh giống nhau, tím tái, khó thở, lịm đi trong 10 phút sau tiêm, kết quả khám nghiệm tử thi ghi nhận có biểu hiện xuất tiết, xung huyết, xuất huyết đa phủ tạng (phổi, tim, gan, thận lách, não, màng ruột).
Đồng thời, phía hội đồng chuyên môn chưa đề cập sự trùng hợp ngẫu nhiên với bệnh lý của trẻ. Bởi tiền sử thai nghén của cả 3 sản phụ bình thường, đẻ thường, khỏe mạnh, bú tốt, cân nặng từ 2,8-3,1 kg.
Nói đến nguyên nhân do vắc xin, hội đồng chuyên môn không loại trừ nhưng cho rằng ít khả năng xảy ra.
Toàn quốc khoảng 600.000 liều vắc xin viêm gan B thuộc 2 lô vắc xin này (2 lô vắc xin tiêm cho 3 trẻ sơ sinh dẫn tới tử vong) đã được sử dụng mà không có báo cáo một trường hợp phản ứng nào. Sự việc xảy ra đồng thời phản ứng ở 2 lô vắc xin khác nhau. Hai lô vắc xin này được kiểm định có giấy phép xuất xưởng của Viện Kiểm định quốc gia Vắc xin và sinh phẩm Y tế.
Cuối cùng, hội đồng chuyên môn kết luận nguyên nhân tử vong do sốc phản vệ chưa rõ nguyên nhân và đề nghị gửi mẫu vắc xin, mẫu nghiệm (máu, mô, phổi, não, gan, thận, tim) đến phòng thí nghiệm quốc gia, Quốc tế để xét nghiệm kiểm định chất lượng vắc xin và chất lạ trong mẫu nghiệm.