Tuyến cao tốc Nội Bài – Lào Cai mặc dù đã thông xe được khoảng 20 ngày, nhưng hiện vẫn đang gặp rất nhiều khó khăn trong hoạt động thu phí đường bộ. Đáng nói, do hoạt động thu phí chưa khép kín đã làm phát sinh tình trạng trốn phí, dẫn tới mâu thuẫn giữa người điều khiển phương tiện và nhân viên thu phí đường cao tốc.