Dồn dập nhiều sửa đổi về thuế như Thông tư 219/2013 Bộ Tài Chính về khấu trừ thuế, cách tính thuế GTGT, các văn bản đính chính, thông báo thu hồi hóa đơn… khiến doanh nghiệp phải gồng mình chạy theo. Theo các chuyên gia, nội dung chính sách thuế hiện nay được áp dụng lại không đồng nhất với Luật và quy định của các ngành nghề trên thực tế, điều này khiến tâm lý các doanh nghiệp lo lắng khi làm việc với các cán bộ cơ quan thuế.
Điều này cho thấy, dù ngành thuế có nhiều nỗ lực cải cách nhưng thực tế thủ tục thuế vẫn chưa tháo gỡ khúc mắc cho doanh nghiệp.