Về đầu mối thu, thành phố chủ trương tổ dân phố sẽ chịu trách nhiệm thu tại từng hộ gia đình. Theo Phó giám đốc Sở Giao thông vận tải Bùi Xuân Cường, mức phí đề xuất thu là 50.000 đồng/năm đối với loại xe có dung tích xylanh đến 100 cm3 (giảm 10.000 đồng so với mức đề xuất vào giữa năm 2013), 120.000 đồng/năm (giảm 30.000 đồng) đối với loại xe trên 100 cm3 - 175 cm3, 150.000 đồng/năm đối với loại xe trên 175 cm3, riêng loại xe chở hàng bốn bánh có gắn động cơ một xylanh mức phí đề xuất thu là 2,16 triệu đồng/năm.
Quy định về thu phí đường bộ đối với xe mô tô, xe gắn máy có hiệu lực từ ngày 1/1/2013. Tuy nhiên, Sở Giao thông vận tải TP HCM đề xuất không truy thu để khuyến khích người dân, tạo tâm lý đồng thuận khi triển khai.