Tiền thân của Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới TP.HCM là Bệnh viện Chợ Quán thành lập năm 1861. Bệnh viện tọa lạc tại làng Chợ Quán, giữa Sài Gòn - Chợ Lớn lúc bấy giờ, bên bờ kênh người Hoa (Arroyo Chinois) nay gọi là kênh Tàu Hũ. Cơ sở ban đầu của bệnh viện là những ngôi nhà mái ngói của người Việt Nam giàu có để lại khi sơ tán, được bổ sung thêm giường bệnh.
Bệnh viện lâu đời nhất Việt Nam là Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới TP.HCM.
Năm 1902, Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức ngày nay được thành lập cùng với sự ra đời của Trường Y khoa Đông Dương, tiền thân của Trường Đại học Y Hà Nội. Năm 1904, Bệnh viện chuyển về vị trí hiện tại với tên gọi Nhà thương bảo hộ. Từ năm 1991 tới nay, Bệnh viện mang tên gọi Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức.
Năm 1911, Bệnh viện Xanh Pôn hiện tại là một cơ sở điều trị nhỏ với 50 giường bệnh. Năm 1930, nơi đây trở thành Bệnh viện Ngoại khoa Saint Paul. Năm 1970, Bệnh viện Đa khoa Xanh Pôn được thành lập trên cơ sở hợp nhất Bệnh viện Ngoại Khoa Saint Paul, Bệnh viện Nhi khoa Hà Nội, Bệnh viện khu phố Ba Đình và Phòng khám Phụ khoa Hà Nội.
Năm 1911, Bệnh viện Bạch Mai được thành lập, ban đầu là Nhà thương Cống Vọng chuyên điều trị bệnh nhân truyền nhiễm. Năm 1935, Bệnh viện mang tên René Robin và năm 1945, đổi tên Bệnh viện Bạch Mai.
Năm 1923, Viện Curie Đông Dương ra đời tại Hà Nội, là tiền thân của Bệnh viện K. Nơi đây hiện là bệnh viện hạng 1 tuyến trung ương, cơ sở chuyên khoa đầu ngành trong điều trị ung thư của cả nước.
