Teo thực quản bẩm sinh thường kèm theo một số dị tật khác cần được can thiệp sớm nên sàng lọc trước sinh đóng vai trò rất quan trọng để cứu trẻ.

Việc các sản phụ đi siêu âm quá nhiều là không cần thiết và gây lãng phí về tài chính cho thai phụ.